توضیحاتی در مورد کتاب :
این جلد به جزئیات رویکردهای تجربی رایج در مطالعات طراحی شده برای روشن کردن فرآیندهای مختلف مورد استفاده برای مطالعه متابولیسم سرطان میپردازد. فصلها به سه بخش تقسیم میشوند، بخش اول بر پروتکلهایی متمرکز است که معمولاً در مطالعات متابولیسم سرطان مورد استفاده قرار میگیرند، مانند پروتکلهایی که شامل روشهای برچسبگذاری ایزوتوپ پایدار، پروتکلهایی برای مطالعه گلیکولیز، گلوکونئوژنز و متابولیسم میتوکندری است. بخش دوم کتاب روشهای مورد استفاده برای تولید فرضیهها و شناسایی نشانگرهای سرطان، مانند ابزارهای پروفایل مبتنی بر طیفسنجی جرمی و NMR را شرح میدهد. آخرین اما نه کم اهمیت، بخش سوم مروری بر موضوعات حیاتی و فعالانه در زمینه متابولیسم سرطان و همچنین رویکردهای روششناسی محاسباتی است. این فصلها با فرمت بسیار موفق مجموعه روشها در زیستشناسی مولکولی نوشته شدهاند، فصلها شامل مقدمهای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرفهای لازم، پروتکلهای آزمایشگاهی گام به گام، قابل تکرار آسان و نکاتی در مورد عیبیابی است. و اجتناب از دام های شناخته شده.
معتبر و پیشرفته،متابولیسم سرطان: روش ها و پروتکل هاهدف دارد مجموعه ای ضروری از پروتکل های مورد استفاده در بسیاری از آزمایشگاه ها باشد.
فهرست مطالب :
Front Matter ....Pages i-xi
Metabolic Labeling of Cultured Mammalian Cells for Stable Isotope-Resolved Metabolomics: Practical Aspects of Tissue Culture and Sample Extraction (Daniel R. Crooks, Teresa W.-M. Fan, W. Marston Linehan)....Pages 1-27
Imaging Cancer Metabolism with Positron Emission Tomography (PET) (Timothy H. Witney, David Y. Lewis)....Pages 29-44
Radioluminescence Microscopy: A Quantitative Method for Radioisotopic Imaging of Metabolic Fluxes in Living Cancer Cells (Debanti Sengupta, Guillem Pratx)....Pages 45-53
Use of 13C315N1-Serine or 13C515N1-Methionine for Studying Methylation Dynamics in Cancer Cell Metabolism and Epigenetics (Alice C. Newman, Christiaan F. Labuschagne, Karen H. Vousden, Oliver D. K. Maddocks)....Pages 55-67
Measurement of Mitochondrial Membrane Potential with the Fluorescent Dye Tetramethylrhodamine Methyl Ester (TMRM) (Sarah Creed, Matthew McKenzie)....Pages 69-76
Assessment of Stabilization and Activity of the HIFs Important for Hypoxia-Induced Signalling in Cancer Cells (David Kung-Chun Chiu, Misty Shuo Zhang, Aki Pui-Wah Tse, Carmen Chak-Lui Wong)....Pages 77-99
Determination of Polarization of Resident Macrophages and Their Effect on the Tumor Microenvironment (Ioannis S. Pateras, Tomer Cooks)....Pages 101-112
Quantitation of Macropinocytosis in Cancer Cells (Koen M. O. Galenkamp, Basheer Alas, Cosimo Commisso)....Pages 113-123
Integrated Analysis of Acetyl-CoA and Histone Modification via Mass Spectrometry to Investigate Metabolically Driven Acetylation (Simone Sidoli, Sophie Trefely, Benjamin A. Garcia, Alessandro Carrer)....Pages 125-147
Methods to Measure Autophagy in Cancer Metabolism (Natalia von Muhlinen)....Pages 149-173
Lipidomic Analysis of Cancer Cell and Tumor Tissues (Islam Sk Ramiz, Soumen Kanti Manna)....Pages 175-204
Mass Spectrometry-Based Profiling of Metabolites in Human Biofluids (Tanushree Chakraborty, Soumen Kanti Manna)....Pages 205-234
Gas Chromatography-Mass Spectrometry and Analysis of the Serum Metabolomic Profile Through Extraction and Derivatization of Polar Metabolites (Jodi Rattner, Farshad Farshidfar, Oliver F. Bathe)....Pages 235-249
Metabolite Profiling of Clinical Cancer Biofluid Samples by NMR Spectroscopy (Beata Mickiewicz, M. Eric Hyndman, Hans J. Vogel)....Pages 251-274
Assessment of Metabolic Signature for Cancer Diagnosis Using Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometric Imaging (Shibdas Banerjee, Soumen Kanti Manna)....Pages 275-297
Compositional Analysis of the Human Microbiome in Cancer Research (Elisa Morales, Jun Chen, K. Leigh Greathouse)....Pages 299-335
Assessing Metabolic Dysregulation in Muscle During Cachexia (Myriam Y. Hsu, Paolo E. Porporato, Elisabeth Wyart)....Pages 337-352
Using Seahorse Machine to Measure OCR and ECAR in Cancer Cells (Jing Zhang, Qing Zhang)....Pages 353-363
Metabolic Profiling of Live Cancer Tissues Using NAD(P)H Fluorescence Lifetime Imaging (Thomas S. Blacker, Michael D. E. Sewell, Gyorgy Szabadkai, Michael R. Duchen)....Pages 365-387
Overview of Characterizing Cancer Glycans with Lectin-Based Analytical Methods (Amanda J. Pearson, Elyssia S. Gallagher)....Pages 389-408
Hyperpolarized MRI for Studying Tumor Metabolism (Mikko I. Kettunen)....Pages 409-426
Overview of Glutamine Dependency and Metabolic Rescue Protocols (Shuo Qie, Dan He, Nianli Sang)....Pages 427-439
Integration of Metabolomics and Transcriptomics to Identify Gene-Metabolite Relationships Specific to Phenotype (Andrew Patt, Jalal Siddiqui, Bofei Zhang, Ewy Mathé)....Pages 441-468
Biclustering Analysis of Co-regulation Patterns in Nuclear-Encoded Mitochondrial Genes and Metabolic Pathways (Robert B. Bentham, Kevin Bryson, Gyorgy Szabadkai)....Pages 469-478
Using the Human Genome-Scale Metabolic Model Recon 2 for Steady-State Flux Analysis of Cancer Cell Metabolism (Lake-Ee Quek, Nigel Turner)....Pages 479-489
Back Matter ....Pages 491-495
توضیحاتی در مورد کتاب به زبان اصلی :
This volume details common experimental approaches in studies designed to illuminate various processes used to study cancer metabolism. Chapters are divided into three parts, the first part focuses on protocols commonly utilized in cancer metabolism studies, such as protocols comprising stable isotope labeling methods, protocols for studying glycolysis, gluconeogenesis and mitochondrial metabolism. The second part of the book describes methods used for generating hypotheses and identifying cancer markers, such as mass spectrometry- and NMR-based profiling tools. Last but not least, the third part is an overview of vital and actively researched topics in the field of cancer metabolism, as well as computational methodological approaches. Written in the highly successfulMethods in Molecular Biologyseries format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.
Authoritative and cutting-edge,Cancer Metabolism: Methods and Protocolsaims to be an essential compilation of protocols utilized in many laboratories.