توضیحاتی در مورد کتاب :
پیشرفتها در فناوریهای ژنومی، مانند ریزآرایهها و توالییابی با توان بالا، قلمرو امکانات را برای جمعآوری دادهها و تجزیه و تحلیل آنها با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک کامپیوتری خودکار، گسترش داده است. با تکمیل توالی ژنوم انسان و چندین ارگانیسم مدل، تلاشی برای اکتشافات علمی توسط تکنیکهای ادغامی و چند بعدی در ریاضیات و علوم محاسباتی تقویت میشود. در این جلد، محققان و کارشناسان برجسته، مروری بر مفاهیم مهم از دیدگاههای بیولوژیکی، ریاضی و محاسباتی ارائه کردهاند. این یک نمای سطح بالایی از ادغام و حاشیه نویسی داده های ژنومی قارچ، طبقه بندی پروتئین ها و شناسایی اهداف واکسن، شناسایی ترشحات یا پروتئین های ترشح شده در ژنوم قارچ، و همچنین ابزارهایی برای تجزیه و تحلیل پروفایل های بیان ریزآرایه ارائه می دهد. * بررسی زیربنای نظری در مورد ابزارها و کاربردهای تکنولوژیکی را ارائه می دهد * ابزارهای مورد استفاده برای حاشیه نویسی ژنوم قارچ ها را مورد بحث قرار می دهد و به مسائل مربوط به تولید حاشیه نویسی خودکار در یک محیط بیوتکنولوژی با توان عملیاتی بالا می پردازد* و کاربردهای مفاهیم و روش های ارائه شده در سراسر جهان را توصیف می کند. کتاب
فهرست مطالب :
Content:
Editorial Board
Page v
Contributors
Pages ix-xi
Preface
Pages xiii-xiv
Dilip K. Arora, Randy A. Berka, Gautam B. Singh
Experimental design and analysis of microarray data Original Research Article
Pages 1-36
Claire H. Wilson, Anna Tsykin, Christopher R. Wilkinson, Catherine A. Abbott
Methods for protein homology modelling Original Research Article
Pages 37-59
Melissa R. Pitman, R. Ian Menz
Phylogenetic network construction approaches Original Research Article
Pages 61-97
Vladimir Makarenkov, Dmytro Kevorkov, Pierre Legendre
Issues in comparative fungal genomics Original Research Article
Pages 99-122
Tom Hsiang, David L. Baillie
Fungal genomic annotation Original Research Article
Pages 123-142
Igor V. Grigoriev, Diego A. Martinez, Asaf A. Salamov
Bioinformatics packages for sequence analysis Original Research Article
Pages 143-160
Yeisoo Yu, Leah A. Santat, Sangdun Choi
A survey of computational methods used in microarray data interpretation Original Research Article
Pages 161-178
Brian Tjaden, Jacques Cohen
Computational methods in genome research Original Research Article
Pages 179-207
Manoj Bhasin, G.P.S. Raghava
Creating fungal pathway/genome databases using pathway tools Original Research Article
Pages 209-225
Suzanne M. Paley, Michelle Green, Markus Krummenacker, Peter D. Karp
Comparative genomic analysis of glycoylation pathways in yeast, plants and higher eukaryotes Original Research Article
Pages 227-248
Shoba Ranganathan, Sangdao Wongsai, K.M. Helena Nevalainen
Genomic rearrangement and disease LARaLINK 2.0: Datamining for clinical cytogenetics Original Research Article
Pages 249-275
Adrian E. Platts, Dawei Wang, Brian Fayz, Robert Lennie, Bin Yao, Stephen A. Krawetz
Sequence-based analysis of fungal secretomes Original Research Article
Pages 277-296
Nicholas O\'Toole, Xiang Jia Min, Gregory Butler, Reginald Storms, Adrian Tsang
Using web agents for data mining of fungal genomes Original Research Article
Pages 297-309
Audrius Meškauskas
Searching biological databases using biolinguistic methods Original Research Article
Pages 311-331
Gautam B. Singh
Keyword index
Pages 333-336
توضیحاتی در مورد کتاب به زبان اصلی :
The advances in genomic technologies, such as microarrays and high throughput sequencing,have expanded the realm of possibilities for capturing data and analyzing it using automatedcomputer driven bioinformatics tools. With the completion of the sequencing of genomes ofhuman and several model organisms, a quest for scientific discoveries being fueled byintegrative and multidimensional techniques in mathematics and computational sciences. Inthis volume, leading researchers and experts have provided an overview of significantconcepts from biological, mathematical, and computational perspectives. It provides a high level view of fungal genomic data integration and annotation, classification of proteins and identification of vaccine targets, identification of secretome or secreted proteins in fungal genomes, as well as tools for analyzing microarray expressionprofiles. * Provides a survey of theoretical underpinnings on the technological tools and applications* Discusses the tools utilized for the annotation of fungal genomes and addresses issues related to automated annotation generation in a high throughput biotechnology environment* describing the applications of the concepts and methodologies presented throughout the book