دانلود کتاب Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes: From Bioinformatics to Molecular Quantum Mechanics
دسته: زیست شناسی
کتاب روشهای محاسباتی برای مطالعه ساختار و دینامیک بیومولکولها و فرآیندهای زیست مولکولی: از بیوانفورماتیک تا مکانیک کوانتومی مولکولی نسخه زبان اصلی
دانلود کتاب روشهای محاسباتی برای مطالعه ساختار و دینامیک بیومولکولها و فرآیندهای زیست مولکولی: از بیوانفورماتیک تا مکانیک کوانتومی مولکولی بعد از پرداخت مقدور خواهد بود
توضیحات کتاب در بخش جزئیات آمده است و می توانید موارد را مشاهده فرمایید
توضیحاتی در مورد کتاب Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes: From Bioinformatics to Molecular Quantum Mechanics
نام کتاب : Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes: From Bioinformatics to Molecular Quantum Mechanics
ویرایش : 1
عنوان ترجمه شده به فارسی : روشهای محاسباتی برای مطالعه ساختار و دینامیک بیومولکولها و فرآیندهای زیست مولکولی: از بیوانفورماتیک تا مکانیک کوانتومی مولکولی
سری : Springer Series in Bio-/Neuroinformatics 1
نویسندگان : Harold A. Scheraga (auth.), Adam Liwo (eds.)
ناشر : Springer-Verlag Berlin Heidelberg
سال نشر : 2014
تعداد صفحات : 809
ISBN (شابک) : 9783642285530 , 9783642285547
زبان کتاب : English
فرمت کتاب : pdf
حجم کتاب : 44 مگابایت
بعد از تکمیل فرایند پرداخت لینک دانلود کتاب ارائه خواهد شد. درصورت ثبت نام و ورود به حساب کاربری خود قادر خواهید بود لیست کتاب های خریداری شده را مشاهده فرمایید.
توضیحاتی در مورد کتاب :
از نیمه دوم قرن بیستم محاسبات ماشینی نقش مهمی در علم و مهندسی ایفا کرده است. تکنیکهای مبتنی بر رایانه در زیستشناسی مولکولی اهمیت ویژهای پیدا کردهاند، زیرا اغلب تنها راه عملی برای به دست آوردن بینش در مورد رفتار یک سیستم بیولوژیکی به عنوان یک کل را نشان میدهند. پیچیدگی سیستمهای بیولوژیکی، که معمولاً نیاز به تجزیه و تحلیل در مقیاسهای زمانی و اندازههای مختلف و با سطوح مختلف دقت دارد، مستلزم بکارگیری رویکردهای متفاوتی است، از تحلیل مقایسهای توالیها و پایگاههای داده ساختاری تا تحلیل شبکهها. وابستگی متقابل بین اجزا و فرآیندهای سلول، از طریق مدلسازی درشت دانه تا شبیهسازیهای دقیق اتمی، و در نهایت به مکانیک کوانتومی مولکولی.
این کتاب مروری جامع از تکنیکهای مبتنی بر کامپیوتر مدرن برای محاسبه ساختار، خواص و پویایی مولکولهای زیستی و فرآیندهای زیست مولکولی ارائه میکند. بیست و دو فصل که توسط دانشمندان از سراسر جهان نوشته شده است، به نظریه و عمل تکنیک های شبیه سازی کامپیوتری در مطالعه پدیده های بیولوژیکی می پردازد. فصل ها در چهار بخش موضوعی با موضوعات زیر گروه بندی می شوند: روش شناسی شبیه سازی های مولکولی. کاربردهای شبیه سازی مولکولی؛ روش های بیوانفورماتیک و استفاده از اطلاعات تجربی در شبیه سازی های مولکولی. و کاربردهای منتخب مکانیک کوانتومی مولکولی. این کتاب شامل یک فصل مقدماتی است که توسط هارولد آ. شراگا، یکی از پیشگامان واقعی در مطالعات شبیهسازی بیوماکرومولکولها نوشته شده است.
فهرست مطالب :
Front Matter....Pages 1-12
Simulations of the Folding of Proteins: A Historical Perspective....Pages 1-23
Coarse-Grained Protein Models in Structure Prediction....Pages 25-53
Coarse-Grained Modeling of Protein Dynamics....Pages 55-79
Physics-Based Modeling of Side Chain - Side Chain Interactions in the UNRES Force Field....Pages 81-107
Modeling Nucleic Acids at the Residue-Level Resolution....Pages 109-149
Modeling of Electrostatic Effects in Macromolecules....Pages 151-193
Optimizations of Protein Force Fields....Pages 195-247
Enhanced Sampling for Biomolecular Simulations....Pages 249-267
Determination of Kinetics and Thermodynamics of Biomolecular Processes with Trajectory Fragments....Pages 269-293
Mechanostability of Virus Capsids and Their Proteins in Structure-Based Models....Pages 295-315
Computer Modelling of the Lipid Matrix of Biomembranes....Pages 317-355
Modeling of Membrane Proteins....Pages 357-431
All-Atom Monte Carlo Simulations of Protein Folding and Aggregation....Pages 433-444
Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins....Pages 445-481
Low-Frequency, Functional, Modes of Proteins: All-Atom and Coarse-Grained Normal Mode Analysis....Pages 483-524
Bioinformatical Approaches to Unstructured/Disordered Proteins and Their Interactions....Pages 525-556
Theoretical and Computational Aspects of Protein Structural Alignment....Pages 557-598
Simulation of the Protein Folding Process....Pages 599-638
13 C Chemical Shifts in Proteins: A Rich Source of Encoded Structural Information....Pages 639-683
When Water Plays an Active Role in Electronic Structure: Insights from First-Principles Molecular Dynamics Simulations of Biological Systems....Pages 685-710
Electronic Properties of Iron Sites and Their Active Forms in Porphyrin-Type Architectures....Pages 711-782
Bioinorganic Reaction Mechanisms – Quantum Chemistry Approach....Pages 783-808
Back Matter....Pages 809-810
توضیحاتی در مورد کتاب به زبان اصلی :
Since the second half of the 20th century machine computations have played a critical role in science and engineering. Computer-based techniques have become especially important in molecular biology, since they often represent the only viable way to gain insights into the behavior of a biological system as a whole. The complexity of biological systems, which usually needs to be analyzed on different time- and size-scales and with different levels of accuracy, requires the application of different approaches, ranging from comparative analysis of sequences and structural databases, to the analysis of networks of interdependence between cell components and processes, through coarse-grained modeling to atomically detailed simulations, and finally to molecular quantum mechanics.
This book provides a comprehensive overview of modern computer-based techniques for computing the structure, properties and dynamics of biomolecules and biomolecular processes. The twenty-two chapters, written by scientists from all over the world, address the theory and practice of computer simulation techniques in the study of biological phenomena. The chapters are grouped into four thematic sections dealing with the following topics: the methodology of molecular simulations; applications of molecular simulations; bioinformatics methods and use of experimental information in molecular simulations; and selected applications of molecular quantum mechanics. The book includes an introductory chapter written by Harold A. Scheraga, one of the true pioneers in simulation studies of biomacromolecules.